jueves, 20 de marzo de 2014

Transducción y perceción de señales

 Las plantas están expuestas, durante todo su ciclo de vida, a distintos tipos de
estímulos.  Como  son  organismos  sésiles  no  pueden  moverse  ni  escapar  de
estos  estímulos,  por  lo  tanto,  han  desarrollado  una  maquinaria  eficiente  para
poder soportarlos.

Los estímulos pueden ser externos e internos. Externos son químicos, físicos o
biológicos (efecto de gravidez, foto periodo, al tipo de luz que ellas perciben,
temperatura, viento, CO2 y el etileno que es una hormona que tiene que ver
con la cobertura de un fruto).


En la zona de las raíces, la planta esta sometida a oxigeno, parásitos, tipo de
suelo, nutriente (cantidad sales), agua disponible, metales tóxicos y al frío.

Estos estímulos varían en cantidad y calidad. Además, pueden variar de minuto
a  minuto.  Aunque  algunos  de  estos  estímulos  no  varían  ni  en  calidad  ni  en
cantidad.

Los alerces son plantas que viven mucho tiempo (se han encontrado de hasta
3500 años). Este es un ejemplo importante por la cantidad de estímulos que
han soportado.

Una  manera  en  que  las  plantas  pueden  responder  a  estos  estímulos  es
cambiando  su  morfología,  por  ejemplo,  las  plantas  dependiendo  del  estímulo
pueden  formar  órganos  (organogénesis  somática)  o  embriones
(embriogénesis somática). La primera es la formación de órganos a partir de   2
células  diferenciadas  y  la  segunda  es  la  formación  de  embriones  a  partir  de
células diferenciadas.




Cuando las plantas producen embriones en todos los extremos de la hoja es
por una estrategia reproductiva

A su vez, las plantas están sometidas a estímulos internos, o sea dentro de la
célula,  y  estos  son  patógenos,  virus,  temperatura,  minerales,  luz,    señales
eléctricas, hormonas, azúcares, aminoácidos. Y la célula cuando llegan estos
estímulos, lo amplifican  dentro de ella, en una cascada de interacciones dentro
de la célula. En este sentido son muy parecidas las células animales con las
vegetales, en cuanto como amplifica la señal con el mismo mecanismo. ¿Cómo
responde la célula?, alterando su crecimiento, metabolismo celular, formando
embriones  u  órganos,  esto  por  cambio  en  el  flujo  de  iones,  en  vías  de
regulación metabólica, regulación muy fina en expresión de genes y cambio en
el citoesqueleto, que da finalmente el cambio en la forma de la célula.

La planta censa  estos  estímulos  a partir de  la  célula.  Por  ejemplo,    censa el
ozono, inundaciones, sequía, sales y esto afecta a distintos órganos o partes
de  la  planta.  No  todas  las  células  responden  igual,    esto  es  por  su
diferenciación,  porque  cambian  los  genes  que  se  están  expresando.  Por
ejemplo,  el ozono afecta solo la parte aérea y las sales afectan las raíces.
La  célula  al  censar  el  estimulo  reconoce  principalmente  el  estrés  y  después
monta una cascada de señalización intracelular que conlleva a cambios en el
núcleo,  expresión  de  genes  formación  de  nuevas  proteínas  y  alteración  del
metabolismo  celular.  Viaja  por  la  célula  y  monta  una  respuesta  generalizada
para defenderse de estímulos externos

Adaptación: a largo plazo, en tiempo evolutivo, y conlleva cambios genéticos, a
nivel de genoma; de especiación.


Aclimatación:  temporal; se produce en un solo individuo, de período corto y
rápido. Un ejemplo sería aquellas plantas que viven a 20 ºC y se ponen a 4 ºC
por una semana y luego a -12 ºC. Ellas pueden sobrevivir porque la planta,  al
estar  a  4  ºC  censó  el  estímulo  de  frío  y  montó  una  maquinaria  de  defensa
frente a el. Luego al ser expuesta a -12 ºC ya tiene montada  la maquinaria y
puede soporta dicha condición.

No  todas  las  plantas  son  capaces  de  responder  a  cualquier  estimulo,  por
ejemplo, características al estrés, muchas de las respuestas dependen de cuan
severo es el daño y esto tiene que ver con las concentraciones (como metales
pesados),    la  duración  del  estímulo,  las  veces  que  ha  sido  expuesta  y  la
combinación de estrés que se potencian entre sí y gatillan una peor respuesta.

Las  características  de  la  planta  dependen  de  qué  órgano  o  tejido  ha  sido
afectado. Por ejemplo,  si se le pone sal a una hoja es menos nocivo que si se
le  pone  a  una  raíz.    La  edad  también  es  importante,  pues  a  más  jóvenes
responden  mejor  a  los  estímulos.  El  genotipo  también  influye,  ya  que  se  da
variabilidad genética y por ende van a existir plantas con mayor resistencia que
otras.

Tipos de respuestas: resistencia o susceptibilidad. Resistencia: sobrevivencia y
crecimiento. Susceptibilidad: muerte.

Existe una corriente que dice que las plantas son inteligentes porque aprenden
del  ambiente,  pues    como  no  se  mueven,  las  células  perciben  traducen  y
evalúan  la  información  entregada  del  ambiente,  al  evaluar  monta  una  red
adaptativa representacional donde el tejido integra esta red.

La planta completa evalúa el fitness, cuanto puede soportar el ambiente,  y de
ahí  el  individuo  completo  realiza  una  respuesta  inteligente  como  cambiar  su
morfología, de expresión de genes y eso a su vez modifica el ambiente y luego
es un fitness. Esto es importante en el cambio climático, donde en muy poco
tiempo los ambientes han variado mucho, y las plantas han logrado modificar
su  estructura  ante  este  cambio.  (Suelos  muy  contaminados  con  sales    las
plantas exudan moléculas que atrapan estos iones)

La planta aprende de sus estímulos internos, y puede sobrevivir.

¿Cómo se traduce esta señal de información que viene del ambiente?, a través
de isoestimulos externos. Las señales son amplificadas  dentro de la célula por
moléculas llamadas segundos mensajeros y los más importantes son el calcio y
kinasas.  Calcio  es  un  ion  divalente  que  existe  en  baja  cantidad  dentro  de  la
célula  y  con  estímulos  puede  aumentar  su  concentración.  Las  kinasas  están
involucradas en la fosforilación de proteínas. El 4% de los genes de las plantas
son distintas kinasas que responden a diferentes estímulos, por lo tanto es una
proteína muy abundante.




Existe una conversión entre ambas, con proteínas que unen calcio con kinasas
dependientes  de  calcio  y  esto  genera  mayor  diversidad  en  la  capacidad  de
respuesta  a  distintos  estímulos.  Y  estos  mensajeros  segundos  gatillan  las
respuestas en la planta.

Hay dos maneras de cómo se traduce la información, esto es por sistemas de
información  genéticos  y  epigenéticos.  Genético  sólo  lo  codificado  en  el
genoma,  genes  principalmente  (es  el  modelo  mas  simple  en  términos
biológicos), y lo epigenético es información que no es codificado en genes pero
que se traduce por la interacción de genes o modificaciones de cromatina. En
un ejemplo clásico del sistema mendeliano de información genética un gen se
transcribe  en el RNAm que luego se traduce a la proteína y genera un carácter
(un  gen  un  carácter).  En  sistema  epigenético,    son  una  red  de  los  distintos
genes  que  interactúan  con  distintas  factores  ambientales  y  que  su  relación
genera caracteres


Otra manera de regulación epigenética es por modificación de cromatina, por
metilación de histonas o metilación del DNA.

Un  ejemplo  clásico  que  es  altamente  regulado  por  señales  externas,  es  la
floración, la transición de un crecimiento vegetativo a la etapa reproductiva. La
floración es regulada por muchas variables, la luz, reloj circadiano, fotoperíodo,
venalización,  la  vía  autónoma  (edad  de  la  planta)  y  las  hormonas.  Existe  un
represor maestro de la floración, FLC. FLC es un represor transcripcional de los
genes FT y SOC1 que a su vez transcriben a los genes AP1 y LFY . El FLC
cuando  la  planta  germina  en  el  embrión  está  siempre  en  un  alto  nivel
reprimiendo  a  la  floración  en  todo  momento  hasta  que  llegan  estímulos
externos y se apaga el gen y se prenden el resto de genes río abajo y se gatilla
la floración. El FLC se regula por vías genéticas y vías epigenéticas. El la vía
autónoma que es la vía en que la planta censa su edad. En la vía epigenética
que  es  la  venalización  cuando  las  plantas  se  ponen  en  frió  a  4  ºC  por  2
semanas y luego se ponen a 20 ºC y luego florece, esto ocurre después del
invierno
2
.  Esto  ocurre  porque  el  frío  gatilla  que  el  locus  del  FLC,  sitio  de  la
cromatina donde esta ubicado se compacte con histonas, se reprima esa zona
y  no  quede  expuesta  a  los  factores  de  trascripción,  entonces  el  gen  FLC  se
apaga (silencia) porque el lugar físico donde esta ubicado se compacto.

Diferentes  señales  producen  diferentes  vías  de  traducción  de  señales  pero
convergen en un punto común que es la expresión de genes.

                                               



 Esto  ocurre  en  la  señal  ambiental  es  censada  por  receptores  de  membrana
que  gatilla  toda  una  cascada  de  señalización  intracelular  que  activan  los
conductores que activan factores de trascripción, conversan entre ellos y van a
expresar distintos genes blanco que participan en distintos estrés ( tolerancia al
estrés y aclimatación).
Cambios  genómicos.  El  frío  es  censado  por  la  membrana  esto  gatilla
liberación de calcio citoplasmático, se activa un factor de transcripción llamado
ICE y este a su vez gatilla la expresión de otros factores de trascripción que
son los CBF (CGF1 CBF2 CBF 3) que a su vez van a activar un regulón CBF
que  son varios genes responsables de la aclimatación al frío

Experimento del 2002 en el cual por
microarrays  (que  se  usa  para  hacer
expresión  global  de  genes)  se
estudió  que  pasaba  con  los  genes
en  frío,  sequía  y  sal  (NaCl)  y  en  el
diagrama  se  ven  cuales  son  los
genes comunes en las vías y únicos.
Por  ejemplo  para  la  respuesta  del
frío  se  evaluaron  7000  genes  de
Arabidopsis.  De  los  23  genes  que
responden  a  esa  señal    21  son
exclusivamente  del  frío,  8  son
compartidos con frío y sequías,  dos
con  el  frío  y  la  sal  y  22  eran
comunes con los tres, entonces tres
señales  ambientales  distintas  son
censadas  en  distintas  vías
convergen    en  que  expresan  un
numero  similar  de  genes,  que  al
tener genes en común van a permitir
la tolerancia a los  3 extremos.


En  sequía  participan  moléculas  señalizadoras  del  ácido  cítrico  que  es  una
hormona que gatilla la expresión de otros CBF (4) que también participan en la
regulación de los CBF

Así si se pone una planta frente a la falta de agua, se activa el regulón CBF que
a  su  vez  permite  la  aclimatación  de  la  sequía  y  la  liberación  del  frío  porque
convergen.

Se puede hacer un by pass de toda esta red metabólica modificando algunos
CBF
Por  ejemplo:  plantas  de  canolas  donde  se  sobreexpresó  el  CBF  3  que  es
activada por frío.
Plantas  de  diez  semanas  donde  7  estuvieron  normal  luego  una  semana  sin
agua  y  después  dos  semanas  normal:  la  planta  silvestre  murió  porque  no
aguantó la falta de agua.
En cambio una planta transgénica respondió bien.
Por lo tanto un gen que en teoría respondería al frío permite la tolerancia a la
sequía.

A su vez también hay cambios no genómicos, cambios iónicos. En este último,
si uno toca una planta esta se contrae, porque tiene sensores de contacto, los
cuales al activarse gatillan liberación de iones en el músculo de la planta (igual
a la contracción muscular). En este caso no hay participación de genes.

Por lo tanto, cambio genómico: involucra activación transcripcional de genes
Cambio no genómico: participan moléculas (iones en este caso)

Como la planta censa estímulos externos, esto es por receptores de dos tipos:
de  superficie  celular  e  intracelular.  Uno  censa  los  que  no  pueden  entrar  a  la
célula y el otro es para  los que entran al citoplasma.

En animales se han identificado tres tipos de receptores. Uno es receptor unido
a proteína G donde una molécula de receptor que está en la membrana censa
una molécula y gatilla la activación de una proteína G que está acoplada a ella
y  esa  proteína  G  que  está  activada,  compuesta  por  tres  subunidades,  se
disocia  una  de  ellas  y  puede  activa  esta  subunidad  de  la  proteína  G  a  otras
enzimas.

El otro es un receptor unido a enzima, receptores kinasa que son homodímeros
que reconocen la señal y este se autofosforila activándose una cascada.

Receptores tipo canales iónicos, un canal censa una molécula abre un poro y
permite el flujo de iones.
 

Estos son receptores descritos en  animales de los cuales existe también evidencia en plantas.


A su vez también el potencial de membrana puede funcionar como receptor, en
este caso al tocar la planta o la luz azul es capaz de modificar estos receptores
de membrana lo que hace que se activen canales transportadores de iones en
este caso de calcio (canales regulados por voltaje). El calcio entra a la célula,
mediado por proteínas kinasa y activa transportadores de potasio y cloro. A su
vez los sensores (receptores) de membrana también pueden ser intracelulares
porque los iones se almacenan en las vacuolas.

El  canal  de  calcio  que  hay  entre  la  vacuola  y  citosol  al  ser  activado  por  una
molécula de IP3 se abre y el calcio sale de la vacuola. Por tanto hay receptores
de membrana, citosol y organelos.

Tipos  de  receptores,  uno  de  los  más  estudiados  es  el  que  se  llama  dos
componentes,  estos  son  descritos  en  bacterias  y  en  plantas  (kinasas  en
animales) se llama de dos componentes porke uno de ellos sirve de sensor y el
otro  de  efector.  El  receptor  es  generalmente  kinasa  que  reconoce  ligando  y
esto gatilla autofosforilación de sus histidinas que están en el intracelular. Estas
histidinas  son  capaces  de  fosforilar  a  la  proteína  efectora  y  la  activan  y  esto
gatilla una cascada de señalización que finalmente gatillan la regulación génica
En  plantas  hay  variaciones  de  los  dos  componentes,  uno  es  el  etileno  que
funciona como dos componentes pero en una sola proteína, el receptor cuando

está el etileno desfosforila  su histidina. En este caso esta función que estaba
en dos proteínas en el caso del  etileno queda como una sola

.

Gen de receptores uno de los más conocidos es el de la floración. Hay un tipo
de  plantas  que  responden  al  fotoperíodo,    las  plantas  de  día  corto    y  de  día
largo.  Las  plantas  tienen  un  umbral  de  luz;  las  plantas  de  día  corto  en
presencia  de,  por  ejemplo,    en  el  verano    o  prima  donde  hay  más  luz  y
oscuridad (barra negra oscuridad barra amarilla más luz)

Si  en  ese  caso  hay  más  luz  que  oscuridad  la  planta  está  en  su  estado
vegetativo y no se reproduce; al pasar la oscuridad, el umbral típico, la planta
florece

Si la planta que tiene a 16 horas de oscuridad y 8 de luz se le pone un impulso
de luz entre medio de la oscuridad, la planta no florece
                                               

  La proteína de membrana que actúa como receptora de etileno (en plantas) posee ambos dominios ( His
–Asp)  mientras  que  en individuos de  otros  kingdom  en los  receptores  equivalentes  (independiente del
ligando) encontramos  dos proteínas  una de membrana para His y otra en el citosol para Asp.



En el otro caso las plantas de día largo con mucha luz florece y con poca luz no
florecen (como las plantas típicas que en invierno no florecen y en primavera si)
si  se  le  pone  flash  de  luz  en  la  oscuridad    florecen.  Esto  se  conoce  como
fotoperíodo que es la respuesta ante el tiempo de  luz y oscuridad.


Existen tres tipos de receptores de luz: citrocromos, fototropinas y triptocromos,
estos se diferencian en que responden a distintos tipos de luz. Las fototropinas
y los triptocromos responden a la luz azul, los citocromos responden a la luz
roja.  Las  fotoropinas  y  triptocromos  están  involucrados  en  el  fototropismo
(plantas en la oscuridad elongan mucho más el tallo) y la de etiolación (plantas
en las oscuridad no quedan con sus cloroplastos y quedan blancas)
Los  citocromos  (luz  roja)  están  involucrados  en  fotoperíodo  (plantas  de  día
corto y largo)


La luz azul y roja son muy importantes para la planta. Estos dos tipos de luz
son censados  por  los  receptores que gatillan  cascadas celulares y  gatillan la
fotomorfogénesis,  la  transición  de  cromoplastos  y  etioplastos en  cloroplastos.
Es  el  paso  de  un  etioplasto  (cloroplasto  inactivo  que  no  es  capaz  de  hacer
fotosíntesis en un cloroplasto) esto en las plantas etioladas, aquellas que son
blancas  es  porque  tienen  mutados  citocromos  o  proteínas  de  la
fotomorfogénesis

La  luz  es  también  importante  para  la  germinación  de  la  semilla,  esta  es
gatillada por la luz roja.
La fotomorfogénesis es regulada por citocromos y triptocromos

Las fototropinas están involucradas en aperturas de estomas, fototropismos y
movimiento  de cloroplastos.

La luz es importante para todo el ciclo de crecimiento de plantas


Proteínas kinasas son receptores
Ej: fitocromo, el pigmento que censa la luz: pictocromo
En  un    macetero  se  pone  la  semilla  a  una  distancia  grande  o  sea  muy
enterrada y nunca va a germinar porque no censa la luz, tiene un umbral que
es el límite que es cual en que la luz penetra, en cambio si se la pone en el
límite germina.

Los fitocromos son kinasas y el cromóforo de ellas es un beta pirrol de cadena
lineal.

Los  fitocromos  existen  de  dos  formas:  inactiva  (circulo)  y  activa  (cuadrado),
todas las respuestas en que están involucradas los citocromos son mediados
por la forma activa

Existen dos tipos de luz roja: de 660 nm y luz roja lejana 630 nm de longitud de
onda. Cuando el fitocromo inactivo, (fitocromo rojo) cuando censa la luz roja se
vuelve activo, que seria el fitocromo rojo lejano. El fitocromo rojo lejano cuando
censa la luz rojo lejano se inactiva y vuelve a ser fitocromo rojo.

El  proceso  es  reversible,  por  ejemplo  las  semillas  cuando  germinan,  el
citocromo activo activa este proceso y cuando no lo necesita se inactiva.
Es un proceso reversible

Las dos hipótesis de cómo la actividad kinasa puede mediar la actividad de un
fitocromo,  uno  es  que  la  kinasa  es  capaz  de  fosforilar  a  otra,  entonces
fitocromo reconoce cromóforo se activa y fosforila a una molécula traductora de
señal (que da la respuesta).
La segunda es similar, pero el fitocromo se activa con el cromóforo viene una
molécula que la fosforila al fitocromo y así el fitocromo puede fosforilar a otra
molécula.

Para  estudiar,  existe  una  mutante  en  tomate  (llamada  áurea)  que  no  tiene
citocromo y  por  lo  tanto es  blanca.  El  experimento es  con protoplastos  de  la
planta (células cultivadas in Vitro), son células de tamaño relativamente grande.
A estas células de áurea se les inyectó directamente al citoplasma citocromo y
al activarla con luz roja los etioplastos pasaron a cloroplastos.

A  la  misma  célula  se  le  inyectó  calcio,  se  la  trato  con  luz  y  pasó  lo    mismo,
significa que el calcio participa en la vía de los citocromos.

La semilla es una etapa muy crítica de la planta por lo tanto es importante que
sepa cuando germinar

Las condiciones óptimas es cuando hay más calor

La germinación es producidas por las giberelinas, una hormona, en condiciones
normales, los genes que codifican la giberelinas  están inactivas (ga3, ga2) son
activados por stp y pic1, son represores. Entonces cuando hay luz adecuada
para  germinar  el  citocromo  se  activa  y  es  capaz  de  destruir  al  represor  y  se
activan  los  genes  para  la  síntesis  de  gerialina.  En  frío  y  al  sacarlas  a  la  luz
germinan inmediatamente. El frío reprime o destruye a los represores.
Por lo tanto frío y luz controlan la germinaron
.

Esta regulación es idéntica en animales y plantas.
                                               

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